O que é uma linhagem?

Uma linhagem é simplesmente descendente de um ancestral comum. Você pode pensar da mesma maneira que é descendente de seus pais, descendentes de seus pais (seus bisavós).

http://techdiem.com/2012/06/12/how-ancestry-com-is-using-big-data-to-map-people-places-and-time/

Na biologia evolutiva, uma linhagem é como um organismo desce de outros organismos em uma escala de tempo muito maior.

Por exemplo, os humanos modernos são descendentes de um macaco ancestral comum que compartilhamos com os chimpanzés. Se voltarmos mais no tempo, esse ancestral semelhante a um macaco compartilha um ancestral comum com um ancestral semelhante a um macaco. (Observe que eu não disse que os humanos eram descendentes de chimpanzés ou macacos: os humanos e os chimpanzés eram descendentes de um ancestral que era semelhante a um macaco e agora extinto. Essa é uma distinção importante).

http://www.lifesci.utexas.edu/faculty/sjasper/bio213/humanevol.html