O Linux é melhor do que o Windows para usar o TensorFlow?

Depende principalmente de si e da sua familiaridade com o sistema operativo. Mas ao escolher qual é melhor para você (distribuições Windows ou Linux) considere as seguintes coisas em mente

1. Tensorflow no Windows leva mais tempo para rodar o mesmo código que rodar no Tensorflow no Linux.<
2. O processo de instalação do Tensorflow é mais fácil no windows do que no linux (mas depende da familiaridade dos usuários com o SO.)
3. É aconselhável instalar o pacote Visual C++ no Windows.
4. A versão da GPU funciona melhor com o Cuda Toolkit e o cuDNN, portanto é aconselhável usar a GPU NVidia sobre a AMD.
5. No windows existe apenas o Python 3.5 (Python 2.7 não é suportado) x64 edition suportado e o uso do Anaconda Python 3.5 é aconselhável.
6. Instalação da Pip pode fazer o problema para o usuário do windows.
7. Ubuntu também tem problema de compilação enquanto constrói com --config=cuda:
8. No meu caso o Tensorflow não funciona com Spyder (e eu vou corrigir isso.).

No último Windows é melhor opção para pessoas que querem brincar com Machine Learning mas não o suficiente sério para trabalhar com Linux. Mas o google torna o Tensorflow útil para fins de pesquisa e a maioria das pessoas usa ou BSD ou Linux para pesquisa.

Apenas habilitar o Subsistema Windows para Linux nas configurações de recursos do Windows e depois instalar sua distro favorita com o Windows Store, fica mais fácil para você lidar melhor com o Tensorflow no windows.

(Isto é baseado na minha experiência do Tensorflow no Linux Distro e para windows, baseado na experiência do meu amigo de usar o Tensorflow no windows 10, também ele não usa docker.)