Se eu usar o ADB para remover bloatware, isso irá prejudicar a minha garantia?

Não. Ele não modifica /sistema. A razão pela qual é importante deixar o /system sozinho hoje em dia é que a maioria dos dispositivos rodando Android 5.0 ou mais recentes começaram a usar o dm-verity para garantir que seu software não foi adulterado antes de realmente carregá-lo. Isto significa que modificar qualquer arquivo no /system mata sua garantia, e o ADB nunca, jamais usou a modificação do /system sem acesso root (somente disponível via ROMs personalizadas para nós, pessoas normais). Quando você limpa um telefone de fábrica, apenas o /data e o /cache são ambos limpos, pois é onde o telefone armazena literalmente tudo o que você faz com ele. Todas as configurações, preferências, dados de aplicativos, aplicativos em si, atualizações de aplicativos do sistema, etc., tudo ao vivo em /dados. Quando você limpa um telefone, tudo isso desaparece. Ele voltará aos padrões (sim, isso inclui a bandeira de primeira execução para o assistente de configuração) e, basicamente, os blocos em branco como se tivesse sido comprado, desde que você não tenha modificado nada em /system ou qualquer partição separada de /data ou /cache. Mudar qualquer outra coisa é altamente desencorajado pela natureza do Android e por uma boa razão. Se você for irresponsável e tentar culpar o fabricante, eles vão rir na sua cara e lhe dizer: "há avisos em toda a Internet sobre como fazer isso". Por que você tentou?"