Qual é a diferença entre Pokémon Ruby, Sapphire e Emerald?

Pokémon Ruby, Sapphire e Emerald são todos jogos baseados na região de Hoenn, mas eles têm diferenças. De facto, o Emerald destaca-se mais dos dois.

Equipas criminosas e seus objectivos
Em Ruby, a equipa principal é a Team Magma, com a Team Aqua a ajudar o jogador a derrubá-lo. O seu principal objectivo é acordar Groudon e expandir a terra sobre os oceanos.

Em Sapphire, a equipa principal é a Team Aqua, com a Team Magma a ajudar o jogador a derrubá-la. Seu principal objetivo é acordar Kyogre e expandir os oceanos.

Em Esmeralda, ambas as equipes são igualmente importantes, ambas se chocam entre si com seus motivos conflitantes. Ambos os lendários Pokémon são acordados e o jogador tem de acordar o Rayquaza para parar a caótica luta entre os dois Pokémon.

A Caverna da Origem
Em Ruby/Sapphire a Caverna da Origem é importante, pois depois de o Kyogre/Groudon ser acordado, o caos ocorre nesta caverna, e o jogador tem de lutar(ou apanhá-los) para salvar o mundo.
Em Esmeralda, como ambos são acordados, os dois têm um showdown nas águas de Sootopolis. O jogador vai até a caverna só para encontrar o Wallace, que pede ao jogador para ir, encontrar e fazer com que o Rayquaza pare a luta. Assim, não há necessidade de uma batalha diretamente com o lendário.

Version exclusives
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(From Bulbapedia)
Também, depois de derrotar a Liga - em Ruby, Latios vagueia pela região à espera de ser apanhado; em Sapphire, Latias; e em Emerald, o jogador tem a escolha entre soltar um deles para vaguear, e o outro se tornaria exclusivo do evento.

A Liga Pokémon
Em Ruby e Sapphire, o oitavo ginásio é um ginásio tipo água controlado pelo líder do ginásio Wallace. Na liga, o campeão é Steven Stone, que usa Pokémon fóssil, de aço e rocha.
Em Esmeralda, porém, o oitavo ginásio foi deixado para ser controlado por Juan, ex-professor de Wallace&apos, quando Wallace passou a ser o campeão de Hoenn, substituindo Steven. Assim, em Esmeralda, o jogador luta com dois treinadores do tipo Água - Juan e seu aluno, Wallace.

Diversos
Emerald tem a Battle Frontier disponível após a liga, apresentada ao jogador por Scott; ambos ausentes em Ruby, bem como Sapphire.
No final do Hoenn dex, apenas em Esmeralda, o Professor Birch oferece ao jogador uma entrada Johto.
Ruby/Sapphire tem vários salões de competição em diferentes cidades e vilas enquanto em Esmeralda todos eles são substituídos por tendas de batalha, em vez disso todos os concursos ocorrem em Lilycove.
Muitos tutores de movimentos e TMs são adicionados em Esmeralda, ausentes em R/S.

Há muitos mais pontos, principalmente coisas adicionadas em Esmeralda, mas nem todos valem a pena serem mencionados aqui.