O Nexus Mod Manager é agora o Vortex?

Sim... e não. Vortex é estritamente falando o substituto para NMM. Apesar de ser o gestor oficialmente suportado para os sites Nexus, é também uma aplicação totalmente nova criada com lições e truques aprendidos com o Mod Organizer. Tem, portanto, uma interface e funcionalidades bastante diferentes, embora as últimas versões do NMM tenham começado a introduzir funcionalidades como a instalação virtual, se bem me lembro.

NMM já não recebe mais actualizações tanto quanto sei, onde o Vortex é agora o foco do Nexus e irá actualizar e melhorar com frequência, incorporando sempre que possível suporte para novos jogos.

Em conclusão, a sua escolha a longo prazo será aprender Vortex ou mudar para o Mod Organizer 2 e utilizar gestores específicos para jogos não suportados pelo MO2. A minha escolha pessoal foi o MO2, que recomendo firmemente como uma ferramenta quase revalidativa em flexibilidade e facilidade de utilização quando se trata de anos de utilização do NMM, mas se estiver à procura da ferramenta oficialmente suportada então sim, o Vortex é o 'novo NMM'.