O desligamento da hipertrofia aumenta o FPS?

No.

Você terá melhores fps com hyperthreading habilitado, porque quando você executa jogos você provavelmente tem outras tarefas em segundo plano. Isto irá beneficiar especialmente os processadores com baixa contagem de núcleos, pois quase todos os jogos estão otimizados para 6 núcleos hoje em dia.

BUT,

tendo no máximo fps com hyperthreading doesn't significa uma experiência suave nos jogos. Hyperthreading geralmente causa microstutter e aí's uma razão por trás disso. Hyperthreading cria threads adicionais para alimentar núcleos com outras tarefas quando o núcleo está à espera de trabalho para fazer e quando perto do uso máximo de cpu pode causar atrasos. Esse atraso muito provavelmente irá mexer com o seu frametime já que os núcleos estão ocupados com outras tarefas e a gpu precisa esperar por um frame. Mexer com o frametime será uma má experiência de jogo.

Também já que você referiu hyperthreading você provavelmente tem um processador Intel. Os processadores Intel têm uma falha de segurança com hyperthreading e recomendamos que você desligue o hyperthreading. Procure por zombieload na web para obter mais informações sobre isso.

O meu último conselho será :

Se você está procurando por jogos, obtenha algo como i5 9600k, ele terá 6 núcleos, 6 threads. Você I'terá fps mais altos, quase sem latência e uma experiência suave e você pode fazer overclock para 5ghz para ficar em par com 9700k em metade do preço.

Desde que eu escreva isso do zero, provavelmente alguém vai encontrar erros, erros de digitação ou outras coisas na minha explicação. Estou aceitando sugestões para editar ou correções na minha resposta.