Qual é a diferença entre um elemento, composto e molécula?

Elementos são um tipo de átomo. Se você tem um pedaço de sódio, todo átomo é sódio, cada um com o mesmo número de prótons.

Um composto possui mais de um elemento quimicamente ligado. Essa ligação é um elo entre os núcleos dos átomos e os elétrons presentes.

Existem três tipos gerais de ligações químicas: ligações iônicas, ligações covalentes e ligações metálicas. Dependendo de qual ligação é usada para fazer um composto, você pode ter um composto iônico, um composto metálico (liga) ou um composto molecular (usa ligações covalentes).

Uma ligação covalente ocorre quando um ou mais pares de elétrons são COMPARTILHADOS por átomos próximos um do outro.

Uma molécula é uma partícula neutra (sem carga geral) que é mantida unida por ligações covalentes. É também a menor parte de um composto molecular que mantém as propriedades (propriedades químicas e físicas) do composto.

Para saber se algo é mantido unido por ligações covalentes, você precisa saber algo sobre eletro-negatividade mas não vou tão longe com esta resposta.

Então, para resumir:
elemento = um tipo de átomo
um composto é um termo geral para mais de um elemento quimicamente ligado
uma molécula é uma partícula neutra mantida junto com ligações covalentes