O que se entende por núcleo de estoque e núcleo personalizado?

Dê uma olhada no gentoo linux. Enquanto o instala, você precisa baixar o sistema de arquivos do linux (it's um arquivo comprimido) e extraí-lo no diretório toplevel (seu diretório "root" ou "/"). Então, você tem a escolha de obter o kernel do stock, ou seja, obter um Kernel Linux sem qualquer alteração ou modificação por si ou pela distribuição, ou pode compilar o seu próprio kernel personalizado, adaptado ao hardware do seu sistema's.

Se quiser uma definição estrita :

Um kernel de stock é o kernel que é "o kernel base" lançado pelo próprio Linus. Ele não contém modificações que se adaptam às suas necessidades

e

Um kernel personalizado seria aquele que você ou a sua distribuição escolhida personaliza para que ele funcione da maneira que você quer ou da maneira que a distribuição pretendia.

Um bom exemplo de um kernel personalizado seria quando você instalasse drivers gráficos. Como, quando eu instalei os drivers nvidia-340xx, eles modificaram meu kernel para que meu kernel trabalhe com os drivers.

Mas em um kernel de estoque, você obtém os ossos nus do Kernel Linux. Você pode encontrar o kernel de ações no The Linux Kernel Archives.

( Nota: existe uma diferença entre os kernels STOCK e GENERIC. Um kernel genérico é aquele que vem com a distro. com um kernel genérico, a distribuição o modifica, em um kernel de ações, ninguém além do Linus o modifica.)

Espera que isto ajude ;)

Meu Kernel: 4.1.6-1-ARCH

Gentoo Linux: https://www.gentoo.org/
Mais sobre este tópico: [SOLVIDO] Diferença entre kernel Linux 2.6.35-19-genérico e 2.6.35.3 [Arquivo]